本篇文章给大家谈谈无尺度网络,以及对应的知识点,希望对各位有所帮助,不要忘了收藏本站喔。
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关键基因和hub基因(生物网络角度)
简单来说,hub基因就是网络中节点连接的瓶颈基因,一个连接了很多节点的基因。 这篇文章仍然来自几篇文章及自己平时的积累,主要阐述关键基因和hub基因。
左边热图从上到下分别代表:green module(A),darkturquoise module(C),black module(E),lightyellow module(G),右边网络图分别对应共表达网络,其中红颜色标记的为连通性较高的hub基因。
实际的情况是,真实的的生物网络中的nodes不符合钟形曲线。而是少数nodes的degree极其高,而大多数nodes的degree相对较低,形成无尺度网络。这些高degree的基因往往有着重要作用。
想找hubgene,必须先理解其概念:网络中处于核心位置的点(基因)。
首先,数据清洗和Hub基因筛选,他们已经把Hub基因找到了,换句话说可以直接跳过数据清洗和特征工程阶段。一共10个关键基因,分为三类,高恶度癌(3)、低恶度癌(2)、正常对照组织(1),分别为20个样本。
什么是无尺度网络
我们还发现,细胞中蛋白质的交互网络也是无尺度的。在这种网络中,如果两种蛋白质能相互反应,就认为是彼此连结的。
无尺度网络的特性,在于其度分布没有一个特定的平均值指标,即大多数节点的度在此附近。
在网络理论中,无尺度网络是带有一类特性的复杂网络,其典型特征是在网络中的大部分节点只和很少节点连接,而有极少的节点与非常多的节点连接。这种关键的节点称为“枢纽”或“集散节点”。
BA模型成功的为无尺度网络找到了一个简单而合理的形成机制。然而,BA模型也有其自身的局限。
无尺度网络的阿喀琉斯之踵
1、年7月27日,《自然》杂志的封面文章标题是《因特网的阿喀琉斯之踵》(Achilles Heel of the Internet)。
2、阿喀琉斯之踵,原指阿喀琉斯的脚跟,因是其唯一一个没有浸泡到神水的地方,是他唯一的弱点。后来在特洛伊战争中被人射中致命,现在一般是指致命的弱点,要害。
3、古希腊神话里面有个关于脚跟是弱点的大力士问题,正确称呼为阿喀琉斯之踵。阿喀琉斯之踵(Achilles Heel),原指阿喀琉斯的脚后跟,因是其身体唯一一处没有浸泡到冥河水的地方,成为他唯一的弱点。
随机网络和无标度网络的区别
该区别是:随机网络的特点:具有泊松分布,每一条边出现的概率都是相等的,属于均匀网络(度分布按指数形式急剧下降,这类网络称为均匀网络)。无标度网络的特点:比泊松分布曲线下降缓慢的多,具有幂律分布。
这两个方面特征的结构特性叫无标度性质,呈现无标度特性的网络属于无标度网络。自然界存在的复杂网络大多属于无标度网络,人类社会的关系网络也属于无标度网络。
无尺度网络同样也出现在商业领域。美国斯坦福大学的W·Powell、加州大学lrvine分校的R·White、亚利桑那大学的W·Koput以及密歇根大学的Smith,共同研究了美国生物技术产业联盟网络的形成。
scale - free network, 现实世界的网络大部分都不是随机网络,少数的节点往往拥有大量的连接,而大部分节点却很少,一般而言他们符合zipf定律,(也就是80/20马太定律)。将度分布符合幂律分布的复杂网络称为无标度网络。
动态IP和静态IP的区别:动态IP,即是DHCP上网,在TCP/IP协议里勾选自动获取即可。动态IP的好处在于可在局域网内多台使用网络的设备不冲突。较适用以家庭及个人使用。